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mosquito® LV genomics 单细胞测序文库制备系统
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mosquito® LV genomics 单细胞测序文库制备系统

     
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mosquito® LV genomics 单细胞测序文库制备系统产品描述

SPT Labtech公司的mosquito LV genomics移液工作站凭借其小体系加样的精准度和稳定表现,已成为众多基因组学实验室的理想选择。其独有的固相置换技术,可以无视任何黏度的试剂或DNA,对25nL-1.2μL样品进行精确加样,并且不需要进行任何液体参数的调整。


它正在改变基因组学实验室的工作方式——mosquito能够精确地在传统实验体积的一小部分(通常不到1/10)建立反应体系,从而大幅减少试剂成本,提高检测通量。


例如高昂的SMART-seq HT(Clontech)试剂盒,将反应体系从25μL降低至2.5μL后,每个样品可以节省250元人民币,一块384孔板可以节省高达8万多元的试剂成本!  而使用mosquito genomics,同样一个试剂盒,可以使用更多的次数。


目前单细胞测序cDNA合成和扩增、文库构建、PCR/qPCR体系建立等实验均已成功在mosquito上实现微缩化和自动化的流程建立。

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应用案例:SMART-seq2单细胞cDNA合成及文库制备

来自斯坦福大学、陈-扎克伯格生物中心以及加州大学旧金山分校的研究人员建立了一个名为Tabula Muris的开源数据库,收录了小鼠的多个细胞类型及其基因表达数据。这项成果发表在《Nature》杂志上。研究团队利用流式分选(FACS)方法和微流体液滴捕获方法,从小鼠20个不同器官中分离出超过10万个细胞,并开展单细胞RNA测序。其中利用FACS方法分离出44949个细胞,并进行了SMART-seq2单细胞测序,其中cDNA合成扩增、文库制备和文库pooling分别使用了SPT Labtech的dragonfly discovery、mosquito  LV genomics以及mosquito X1进行移液操作。

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应用案例:CEL-seq2单细胞测序

《Nature》杂志发布了人类精细肝脏细胞图谱,分析了来自9个人类donor的10000多个肝脏细胞,并进行了深度的单细胞RNA测序,分析了不同细胞类型的基因表达情况,该图谱记录了所有重要的肝细胞类型,包括肝细胞、肝主要代谢细胞、血管内皮细胞、肝脏巨噬细胞和其他免疫细胞类型,以及胆管细胞和肝上皮祖细胞,并找到了多种新型肝脏细胞。该研究中基于384孔板的单个细胞scRNA-seq,CEL-seq2步骤由mosquito完成。单细胞的分离通过分选流式收集到384孔板内,接着通过改进的CEL-seq2 protocol进行cDNA的合成和体外mRNA的扩增,cDNA第一链合成仅在400nL体系内进行。利用mosquito将反应体系微缩化后,即使总反应体积仅为原来的1/5。

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mosquito genomics 系列分为三个型号,mosquito LV genomics为多道加样,加样范围 25-1200nL;mosquito HV genomics加样范围为0.5-5μL,同样为多通道加样; mosquito X1为单道加样,主要用于DNA normalization,cherry pick 和pooling,具体配置差异见下表:

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mosquito® LV genomics 单细胞测序文库制备系统应用领域

PCR,qPCR体系微缩化 (2ul)

单细胞测序SMART-seq2, CEL-seq2

二代测序文库制备Illumina, NEB, KAPA, Vazyme

Pooling&Normolisation


mosquito® LV genomics 单细胞测序文库制备系统技术参数

移液范围

25 nL - 1.2 µL

速度

2 minutes/ 96-well plate, 3 minutes/ 384 well copy, 5 minutes/ 4 x 384 plate stamp out

支持板型

96, 384 and 1,536

配件

Active humidity chamber, spool cover, plate processor integration (MoPP)

重量

27 kg (59 lbs)

尺寸

390 mm (790 mm 5 plate deck) x 470 mm x 690 mm

台面

2 或5 板位


mosquito® LV genomics 单细胞测序文库制备系统备注与注意事项

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